उनके इस्तीफे (Resign) के कारण का फिलहाल पता नहीं चल पाया है लेकिन बुधवार को उन्होंने अपने पद से इस्तीफा दिया है। उन्होंने अपना इस्तीफा राष्ट्रपति को भेज दिया है।
बैजल ने निजी कारणों का हवाला देते हुए अपना इस्तीफा राष्ट्रपति राम नाथ कोविंद को भेज दिया है।
पूर्व नौकरशाह बैजल ने 31 दिसंबर 2016 को श्री नजीब जंग के इस्तीफे के बाद इस पद का कार्यभार संभाला था।